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探索生命奥秘 基因科技造福人类

2021年08月31日

华为OceanStor海量存储帮助华大基因有效提升基因测序效率

客户介绍

华大基因于1999年在北京正式成立,2007年成立深圳华大基因研究院,并相继成立了香港华大、美洲华大、欧洲华大及日本华大等分支机构,业务遍及全球。先后完成“人类基因组计划”中国部分(1%)、国际人类单体型图计划(10%)、第一个亚洲人基因组图谱(“炎黄一号”)、水稻基因组计划、大熊猫基因组计划等,在世界基因测序上的贡献超过50%。华大基因秉承“基因科技造福人类”的愿景,以推动生命科学研究进展、生命大数据应用和提高全球医疗健康水平为出发点,基于基因领域研究成果及精准检测技术在民生健康方面的应用,致力于加速科技创新,减少出生缺陷,加强肿瘤防控,抑制重大疾病对人类的危害,实现精准治愈感染,全面助力精准医学。

项目需求

基因测序其实是信息技术和生物技术紧密结合的一个行业,华大基因需要借助高性能计算和高效的存储来处理每天的数据产出。目前华大基因大概有200 多台测序仪,主要的核心业务是无创产前基因检测相关业务。新生胎儿基因测序每天大约产生1 万个样本 , 与数万个正常胎儿几十TB 的基因组数据进行差异统计分析,数据计算量巨大。华大基因在存储上面主要面临四个挑战:

• 每个到华大做基因检测的用户都希望快速的能拿到自己的报告。

• 每个月产出300T的数据,到目前已经有22个PB的数据,如何处理这种爆炸性的数据增长。

• 大量的数据,如何进行数据的生命周期的有效管理。

• 着眼未来,如何搭建一个弹性的,可快速扩展的高性能的存储系统。

解决方案

• 华为OceanStor海量存储承载华大基因无创产前基因检测业务模型分析,单HDD节点2.8GB/s 带宽的高性能读写访问,整体性能比原系统性能提升20%。

• OceanStor海量存储单文件系统提供高达140PB的存储容量,有效满足国家基因库当前海量数据存储以及未来多年的数据发展要求。

• 加上OceanStor海量存储自动分级特性,满足对冷/热数据分级管理的需求,整体提升了存储效率、数据分析能力以及处理性能。

客户价值

• 25%~30%存储性能提升

• 基因检测报告从15天缩短到7天

• 单个文件系统能够达到140PB,灵活线性扩展到288节点

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